Устройство для расшифровки ДНК за 900 долларов

Oxford Nonopore пред­ста­вила на кон­фе­рен­ции Advances in Genome Biology and Technology во Фло­риде, два новых устрой­ства для секве­ни­ро­ва­ния генов. Осо­бого вни­ма­ния заслу­жи­вает Minion, устрой­ство доста­точно мало, чтобы поме­ститься в руке. Оно может быть под­клю­чено к USB-порту ноутбука.

Дру­гой раз­ра­бот­кой явля­ется GridION – уве­ли­чен­ная вер­сия, кото­рая может быть уком­плек­то­вана допол­ни­тель­ной вычис­ли­тель­ной мощ­но­стью. Обе машины пола­га­ются на тех­но­ло­гии, в соот­вет­ствии с кото­рыми нано­поры (стро­и­тель­ные белки) исполь­зу­ются для «про­тя­ги­ва­ния» нитей ДНК через отвер­стия, где мик­ро­чип изме­ряет малей­шие изме­не­ния элек­три­че­ского тока в мем­бране вокруг него. Бла­го­даря тому, как это дела­ется, гораздо больше участ­ков ДНК может быть рас­смот­рено сразу, что устра­няет необ­хо­ди­мость изу­чать неболь­шие участки самостоятельно.

Секве­ни­ро­ва­ние генов - про­цесс, в кото­ром опре­де­ля­ется хими­че­ский поря­док ДНК-единиц (T, C, G и А). Это помо­жет иссле­до­ва­те­лям и вра­чам опре­де­лить наслед­ствен­ность черт живот­ных и рас­те­ний. Заяв­ле­ние Oxford Nonopore ста­вит в тупик посто­ян­ных игро­ков этой ниши рынка: аме­ри­кан­ских ком­па­ний Illumina и Life Technologies.

В допол­не­ние к их неболь­шому раз­меру, новые устрой­ства могут выпол­нять Секве­ни­ро­ва­ние быст­рее, чем ана­ло­гич­ные машины. Пред­ста­ви­тели Oxford Nonopore гово­рят, что 20 еди­ниц GridION  (с добав­ле­нием до при­мерно $ 5000), соеди­нен­ных между собой,  могут секве­ни­ро­вать весь геном чело­века всего за пят­на­дцать минут. Для срав­не­ния, новый про­дукт Life Technologies под назва­нием Ion Proton Sequencer, по цене почти в $ 150,000, справ­ля­ется с этой зада­чей за два­дцать четыре часа.

MinION вызы­вает наи­боль­шее вол­не­ние в науч­ном сооб­ще­стве. Всего за  $ 900, любой иссле­до­ва­тель, откуда угодно, может взять обра­зец, поме­стить его в устрой­ство, а затем под­клю­чить к ноут­буку, и почти мгно­венно полу­чить инфор­ма­цию  рас­шиф­ро­ван­ного генома. Иссле­до­ва­тели из семе­но­вод­че­ских ком­па­ний  могут исполь­зо­вать устрой­ство для ана­лиза куль­тур в поле, напри­мер, чтобы уви­деть какие куль­туры были сме­шаны с дру­гими куль­ту­рами из вне; инспек­торы по кон­тролю за каче­ством мяса могли бы исполь­зо­вать это иссле­до­ва­ние для обна­ру­же­ния раз­лич­ных видов мик­ро­ор­га­низ­мов; био­логи могли бы исполь­зо­вать его для поиска неболь­ших изме­не­ний в генах  в тече­ние поколений.

Коли­че­ство при­ме­не­ний поис­тине огромно.
Есть один малень­кий недо­ста­ток: устрой­ство имеет четы­рех­про­цент­ную ошибку резуль­тата. Это слиш­ком высо­кая погреш­ность для мно­гих при­ме­не­ний, хотя ком­па­ния гово­рит, что она может зна­чи­тельно сни­зить погреш­ность до выпуска про­дукта в этом году.

© 2012 Мир Инно­ва­ций

Похожие новости

• Март 13, 2012 -- Исследователи нашли способ как увеличить эффективность химиотерапии
• Январь 21, 2012 -- Наночастицы наносят удар по раку простаты
• Январь 16, 2012 -- Наноразмерные биологические покрытия — новый способ остановки кровотечения
• Декабрь 23, 2011 -- Американские военные готовятся получить первые портативные сканеры головного мозга
• Ноябрь 2, 2011 -- Воздушные фильтры захватывающие вирус гриппа