Алгоритм Google помогает обнаружить рак

Алго­ритм, исполь­зу­е­мый Google для опре­де­ле­ния стра­ниц, име­ю­щих отно­ше­ние к запросу (реле­вант­но­сти), также может быть исполь­зо­ван для опре­де­ле­ния у рако­вых паци­ен­тов бел­ков, ответ­ствен­ных за про­грес­си­ро­ва­ние заболевания.

Иссле­до­ва­тели из Дрез­ден­ского тех­ни­че­ского уни­вер­си­тета,  Гер­ма­ния, исполь­зо­вали моди­фи­ци­ро­ван­ную вер­сию алго­ритма PageRank от Google для ран­жи­ро­ва­ния 20000 бел­ков по их гене­ти­че­скому отно­ше­нию к про­грес­си­ро­ва­нию рака под­же­лу­доч­ной железы.

В своем иссле­до­ва­нии, опуб­ли­ко­ван­ном в жур­нале PLoS Computational Biology, они обна­ру­жили семь бел­ков, кото­рые могут помочь врачу оце­нить, насколько агрес­сивна опу­холь паци­ента и дол­жен ли он полу­чать химио­те­ра­пию или нет.

Алго­ритм Google был исполь­зо­ван в дан­ном иссле­до­ва­нии, чтобы найти новые био­мар­керы рака.

Био­мар­ке­рами явля­ются моле­кулы, про­из­во­ди­мые рако­выми клет­ками. Они могут помочь обна­ру­жить рак на ран­них ста­диях в жид­ко­стях тела или непо­сред­ственно в опу­хо­ле­вой ткани, полу­чен­ной при опе­ра­ции или биоп­сии. Обна­ру­же­ние этих био­мар­ке­ров– тру­до­ем­кий про­цесс, отни­ма­ю­щий много вре­мени. Дру­гая про­блема заклю­ча­ется в том, что мар­керы, най­ден­ные в раз­лич­ных иссле­до­ва­ниях у боль­ных одними и теми же рако­выми забо­ле­ва­ни­ями не идентичны.

Эта про­блема была решена бла­го­даря изоб­ре­те­нию кам­па­нии Google, кото­рое учи­ты­вает содер­жи­мое веб-страницы, а также как эти стра­ницы свя­заны с помо­щью гиперс­сы­лок. В каче­стве модели, авторы исполь­зуют тот факт, что белки в клетке свя­заны через сеть физи­че­ских и нор­ма­тив­ных взаимодействий.

Как только мы доба­вили инфор­ма­цию о сети в нашем ана­лизе, наши био­мар­керы стали более вос­про­из­во­ди­мым”,- ска­зал Кри­стоф Вин­тер (Christof Winter), автор пуб­ли­ка­ции.

Исполь­зуя эту инфор­ма­цию, сеть и алго­ритм Google, было най­дено сов­па­де­ние, кото­рое под­твер­жда­лось более ран­ним иссле­до­ва­нием Уни­вер­си­тета Север­ной Каро­лины. Там связь была с бел­ком, кото­рый может оце­нить агрес­сив­ность рака под­же­лу­доч­ной железы.

Новые био­мар­керы могут стать отлич­ным допол­не­нием или аль­тер­на­ти­вой суще­ству­ю­щим мето­дам диа­гно­стики рака, пока же они далеки от совер­шен­ства и по-прежнему должны про­хо­дить иссле­до­ва­ния, прежде чем смо­гут быть исполь­зо­ваны в кли­ни­че­ской практике.

Полу­чен­ные зна­ния можно исполь­зо­вать для созда­ния новых пре­па­ра­тов, кото­рые замед­ляют про­грес­си­ро­ва­ние рака. Пер­вым шагом в этом направ­ле­нии явля­ется сотруд­ни­че­ство группы с дрез­ден­ской био­тех­но­ло­ги­че­ской ком­па­нией RESprotect, кото­рая рабо­тает над кли­ни­че­скими испы­та­ни­ями пре­па­рата от рака под­же­лу­доч­ной железы.

По дан­ным medicaldaily.com

© 2012 Мир Инно­ва­ций

Похожие новости

Ответить

Фотогалерея

Войти