Алгоритм Google помогает обнаружить рак
Алгоритм, используемый Google для определения страниц, имеющих отношение к запросу (релевантности), также может быть использован для определения у раковых пациентов белков, ответственных за прогрессирование заболевания.
Исследователи из Дрезденского технического университета, Германия, использовали модифицированную версию алгоритма PageRank от Google для ранжирования 20000 белков по их генетическому отношению к прогрессированию рака поджелудочной железы.
В своем исследовании, опубликованном в журнале PLoS Computational Biology, они обнаружили семь белков, которые могут помочь врачу оценить, насколько агрессивна опухоль пациента и должен ли он получать химиотерапию или нет.
Алгоритм Google был использован в данном исследовании, чтобы найти новые биомаркеры рака.
Биомаркерами являются молекулы, производимые раковыми клетками. Они могут помочь обнаружить рак на ранних стадиях в жидкостях тела или непосредственно в опухолевой ткани, полученной при операции или биопсии. Обнаружение этих биомаркеров– трудоемкий процесс, отнимающий много времени. Другая проблема заключается в том, что маркеры, найденные в различных исследованиях у больных одними и теми же раковыми заболеваниями не идентичны.
Эта проблема была решена благодаря изобретению кампании Google, которое учитывает содержимое веб-страницы, а также как эти страницы связаны с помощью гиперссылок. В качестве модели, авторы используют тот факт, что белки в клетке связаны через сеть физических и нормативных взаимодействий.
“Как только мы добавили информацию о сети в нашем анализе, наши биомаркеры стали более воспроизводимым”,- сказал Кристоф Винтер (Christof Winter), автор публикации.
Используя эту информацию, сеть и алгоритм Google, было найдено совпадение, которое подтверждалось более ранним исследованием Университета Северной Каролины. Там связь была с белком, который может оценить агрессивность рака поджелудочной железы.
Новые биомаркеры могут стать отличным дополнением или альтернативой существующим методам диагностики рака, пока же они далеки от совершенства и по-прежнему должны проходить исследования, прежде чем смогут быть использованы в клинической практике.
Полученные знания можно использовать для создания новых препаратов, которые замедляют прогрессирование рака. Первым шагом в этом направлении является сотрудничество группы с дрезденской биотехнологической компанией RESprotect, которая работает над клиническими испытаниями препарата от рака поджелудочной железы.
По данным medicaldaily.com
© 2012 Мир Инноваций